Podzemné miesto, kde bolo zvykom pochovávať mŕtvych, zvyčajne sa nachádzalo pod hlavným poschodím kostola. Krypty sa nachádzali vo vnútri katakomb, podzemných galérií, ktorých hlavným účelom bolo pochovávať mŕtvoly a kde boli na posledný odpočinok umiestnené náboženské osobnosti, ako sú pápeži alebo mučeníci. Krypty boli zdobené obrazovými znázorneniami a mozaikami, ktoré reprodukovali výjavy z Biblie.
Prvé krypty mali skrývať mučeníkov profánnych a pre ne sa kopali do skál. Bolo to potom, ako boli tieto kostoly vyvýšené nad týmito hrobmi.
V súčasnosti sú skalné komory, v ktorých sa nachádzajú telá zosnulých, známe ako krypta, ktorá môže byť v katedrálach, ale aj na verejných alebo súkromných cintorínoch a rozšírená na miestach, ktoré existujú v akejkoľvek podzemnej budove.
Krypty sa časom začali stavať na cintorínoch. Funkcia sa od svojho vzniku nezmenila: na tomto type miesta sú uložené pozostatky ľudí. Ak je krypta postavená na úrovni tejto zemi, nazvaný mauzóleum.
Pohrebiská boli zvyčajne podzemné galérie vyhĺbené do zeme, nazývané aj katakomby. V nich bol konkrétny priestor venovaný pochovávaniu mŕtvych a tým miestom bola krypta. Krypty mali väčšinou na strope strešné okno, ktoré uľahčovalo osvetlenie a vetranie miesta. Okrem cintorínskej funkcie sa toto miesto využívalo aj na náboženské bohoslužby.
V každom prípade sa katakomby, v ktorých sa krypty stavali, budovali ďalej, až kým cisár Theodosius v roku 380 po Kristovi neurobil kresťanstvo oficiálnym náboženstvom Rímskej ríše.
Na druhej strane, v botanike je krypta hlboká diera, ktorú má nejaká zelenina. Napríklad listy určitých xerofytických rastlín môžu mať svoje prieduchy skryté v kryptách, to znamená v otvoroch (stomatálne krypty).
Mnoho dnešných kresťanských kostolov bolo postavených na pôvodných katakombách a kryptách. Tieto miesta stále navštevujú niektorí pútnici. V nich je možné nájsť hrobky svätých a mučeníkov ranokresťanskej cirkvi a zároveň spoznať symbolické prvky ranokresťanského umenia (krizón, ktorý odkazuje na postavu Krista, obrazy dobrého pastiera, obrazy Páva ako reprezentácia nesmrteľnosti duše alebo Kotvy, ktorá symbolizuje budúci život).
