Mikroorganizmy možno definovať ako druh živých bytostí malých rozmerov do tej miery, že sú pre ľudské oko neviditeľné. Môžu to byť rôzne druhy, medzi najdôležitejšie patria riasy, huby, baktérie atď. Existujú ľudia, ktorí zachovávajú hypotézu, že niektoré mikroorganizmy boli predchodcami života na planéte Zem, zatiaľ čo iné trochu komplikovanejšie predpoklady potvrdzujú, že ide o mimozemský pôvod, ktorý sa v tom čase rozširoval po celej planéte a život všetkému, čo je dnes. Všeobecne je veľmi bežné, že mikroorganizmy sú tvorené bunkou jedinečné, to však neznamená, že neexistujú bunky zložené z viac ako jednej bunky.
Štúdium mikroorganizmov, vedené potrebou čeliť chorobám, malo veľký impulz, a preto sa medicína vyvíjala rovnakým spôsobom ako poznatky o týchto živých bytostiach.
Určité mikroorganizmy sa považujú za zodpovedné za škodu na určitých potravinách, ktorá môže byť škodlivá pre tých jedincov, ktorí konzumovali také potraviny, a spôsobovať rôzne choroby. Napriek tomu existujú určité mikroorganizmy, ktoré môžu prispievať k rôznym postupom, príkladom toho je fermentácia, pri ktorej sa uvedené organizmy používajú na výrobu potravín, ako sú jogurty alebo syry, to znamená, že existujú mikroorganizmy, ktoré môžu zmeniť konfiguráciu určitých potravín alebo dokonca predĺžiť ich životnosť.
Mikroorganizmy, ktoré majú najväčšiu prítomnosť v prírode, sú baktérie, ktoré sa nachádzajú v rôznych typoch biotopov. Existujú baktérie, ktoré môžu byť škodlivé pre ľudské zdravie. Príkladom toho je „ Escherichia coli “, ktorý je zodpovedný za choroby, ako je septikémia. Napriek tomu existujú ďalšie baktérie, ktoré môžu byť pre telo prospešné, napríklad „Lactobacillus acidophilus“, ktorý je schopný produkovať rôzne látky, ako je vitamín K a peroxid vodíka, čo môže veľmi pomôcť organizmus.
