Baktérie sú jedným z najzaujímavejších mikroorganizmov vo všetkých mikroorganizmoch študovaných z mikrobiológie. Vyšetrovania, ktoré majú tieto mikroskopické a jednobunkové bytosti ako protagonistov, majú zvyčajne priamy dopad na rôzne oblasti záujmu vedy a všetkých druhov ľudských aktivít, od medicíny po poľnohospodárstvo.
Ak vezmeme do úvahy výživu prokaryotov, nájdeme všetky možnosti, ktoré existujú v živých bytostiach. Nie je prekvapením, že baktérie sú prvými organizmami prítomnými na Zemi a za miliardy rokov, ktoré sa vyvinuli, sa prispôsobili všetkým možným prostriedkom a formám výživy.
Heterotrofy, väčšina prokaryotických buniek je heterotrofných. To znamená, že svoju potravu získavajú zabudovaním organickej hmoty tvorenej inými živými bytosťami. Z nich je väčšina saprofyty, čo znamená, že sa živia odumretou organickou hmotou a prispievajú tak k recyklácii hmoty v ekosystémoch.
Môžu vykonávať aeróbne katabolizmy - s použitím kyslíka - a anaeróbne, prostredníctvom fermentácií, z ktorých mnohé sú užitočné pre náš priemysel.
Existujú heterotrofné baktérie, ktoré žijú spojené s inými organizmami so vzájomným prospechom, takže by boli symbiotické. Jasným príkladom je Escherichia coli, baktéria, ktorá žije v črevnom trakte človeka. Mnoho bylinožravcov môže využívať celulózu vďaka mikrobiálnej flóre v ich zažívacom trakte, ktorá obsahuje enzým celuláza. Ďalšou symbiózou je symbióza niektorých rastlín s baktériami, ktoré fixujú atmosférický dusík (Rhizobium), v ktorých rastlina využíva časť dusíka fixovaného baktériami, ktorá naopak využíva časť cukrov v tejto rastline.
Mnoho ďalších sú paraziti, využívajú organické látky inej živej bytosti a spôsobujú jej stratu; To platí pre všetky patogénne baktérie, ktoré spôsobujú choroby. Niektoré patogény (chlamýdie, rachitída a niektoré mykoplazmy) zjednodušili svoju štruktúru a môžu sa množiť iba v inej bunke: sú povinnými parazitmi.
V rámci exotickej skupiny myxobaktérií, typu klzkých baktérií, ktoré majú schopnosť agregovať niekoľko buniek a vytvárať štruktúry, ktoré im umožňujú migráciu, patria aj také, ktoré sú predátormi iných baktérií.
Baktérie sa živia týmito zdrojmi a ako sme už poznamenali, ich stratégie prežitia sú veľmi rozmanité. Niet pochýb o tom, že všetky sú príkladom evolučnej adaptácie v priebehu dejín a sú nimi dodnes a majú zásadnú úlohu v prírode a životných cykloch našej planéty.
