Pojem náboženská neznášanlivosť označuje formu neznášanlivosti proti náboženským vieram alebo praktikám alebo, ak to tak nie je, nedostatok takýchto zvykov, ktoré osoba alebo skupina vlastní. Môže to byť spôsobené niekoľkými faktormi, medzi nimi možno spomenúť skutočnosť, že majú rôzne náboženské viery, majú inú ideológiu, ako aj jednoduchá skutočnosť, že majú protináboženský sentiment. Tento typ postoja môže viesť dokonca k agresiifyzické, verbálne, psychologické a iné. Jasný príklad tohto typu neznášanlivosti v oblasti náboženského prenasledovania, ktorá sa dnes vyskytuje v rôznych oblastiach sveta. Hlavná príčina toho, že sa tento typ postojov spoločnosti odohráva, je hlavnou príčinou absencie náboženskej tolerancie, slobody náboženského vyznania a pluralizmu, pokiaľ ide o náboženstvo.
Je dôležité poznamenať, že neexistuje jediná príčina, ktorá by vysvetľovala náboženskú neznášanlivosť, je však možné hovoriť o veľmi zovšeobecnenej hádke medzi tými, ktorí vyznávajú jedno náboženstvo a netolerujú iné. Tento argument je veľmi jednoduchý: všeobecne každý považuje svoje náboženstvo za pravé, z tohto dôvodu je normálne, že protirečí z ich pohľadu tým, ktorí bránia falošné doktríny.
Toto je fenomén starý ako správny pôvod náboženstva. V dávnych dobách, keď prví kresťania vykonávali svoje obrady, sa museli skrývať v katakombách, pretože vtedajšie rímske úrady takéto viery netolerovali. Odpradávna boli židovskí občania mnohokrát vo svojej histórii obeťami prenasledovania a hlavnou motiváciou tohto prenasledovania bolo práve nepriateľstvo voči zvykom a viere, ktoré zastávajú.
Na druhej strane proti náboženskej vízii predkolumbovských národov bojovali kresťania pri príchode na americký kontinent. Aj v samotnom kresťanstve sa vyskytli prípady neznášanlivosti voči iným kresťanským doktrínam, ktoré sa klasifikovali ako herézy alebo odchýlky od autentickej viery. Všetky tieto spomenuté prípady sú znakom toho, že odmietanie a netolerancia viery ostatných je konštantou, ku ktorej došlo od nepamäti a trvá dodnes.